Conform acordului dintre Parlament şi Consiliu, sediul agenţiei va fi în Tallin (Estonia). Cu toate că sarcinile legate de dezvoltarea tehnică şi pregătirea pentru gestionarea operaţională a SIS II şi VIS au fost deja efectuate în Strasbourg (Franţa) şi un site de rezervă pentru aceste sisteme informatice a fost deja instalat la Sankt Johann, în Pongau (Austria), sediul va rămâne la Tallin.  Rezoluția PE a fost adoptată cu 607 voturi pentru, 48 împotrivă și 14 abțineri.

 SIS II este menit să contribuie la asigurarea unui nivel ridicat de securitate în cadrul spaţiului de libertate, securitate şi justiţie al UE, menţinând securitatea şi ordinea publică.

 VIS permite consulatelor şi altor autorităţi competente să facă schimb de informaţii privind vizele, în scopul de a facilita procedura de solicitare de viză, de a preveni "visa shopping", de a contribui la lupta împotriva fraudei, de a facilita controalele la frontierele externe, şi de a acorda asistenţă în identificarea resortisanţilor ţărilor terţe.

 EURODAC este un sistem informatic care facilitează instituirea unui mecanism de determinare a responsabilităţii privind solicitările de azil prezentate într-unul dintre statele membre ale UE.

 În afară de SIS II, VIS şi EURODAC, agenţia va fi de asemenea responsabilă pentru gestionarea oricăror alte sisteme informatice, care ar putea fi dezvoltate în viitor în spaţiul de libertate, securitate şi justiţie. Cu toate acestea, orice integrare de sisteme suplimentare va necesita o decizie specifică a Parlamentului şi a Consiliului.